斑马鱼一键式图像分析软件
Athena 是一款丰富而简单的基于应用的图像分析软件,可以简单快速地评估细胞生物学实验结果。Athena 只需按一下按钮即可执行常见和高级细胞生物学应用。
WiScan Athena 是一款用于应用分析和可视化基于图像的实验的软件工具。该软件结合了嵌入式分析算法、统计评估工具和亚群分析工具,基于先进的细胞定量工具来测量荧光强度和形态特征。它由一个预建的分析模块库组成,这些模块应用于标记和非标记细胞的数据集,因此 Athena 能够分析在明场和荧光照明显微镜下获得的图像。
产品详情
WiSoft® Athena:一键式图像分析软件
直观、强大、精确
Athena 是一款丰富而简单的基于应用的图像分析软件,可以简单快速地评估细胞生物学实验结果。Athena 只需按一下按钮即可执行常见和高级细胞生物学应用。
最常见的细胞生物学应用的分析平台
WiScan Athena 是一款用于应用分析和可视化基于图像的实验的软件工具。该软件结合了嵌入式分析算法、统计评估工具和亚群分析工具,基于先进的细胞定量工具来测量荧光强度和形态特征。它由一个预建的分析模块库组成,这些模块应用于标记和非标记细胞的数据集,因此 Athena 能够分析在明场和荧光照明显微镜下获得的图像。
易于使用,按钮操作
所有级别的用户都可以轻松接受培训,并可以简单独立地使用该平台。Athena 提供了一组现成的应用程序,只需按一下按钮即可加载,用户在进行温和的参数校准后,几分钟内即可开始分析。用户界面和用户体验针对基于图像的细胞生物学实验进行了优化。高内涵图像分析的新手可以使用 Athena 针对最常见的细胞生物学应用预先配置的模板立即开始工作。
分析可以以细胞为单位进行,也可以在群体水平上进行。
可以测量和量化单个细胞,以进行单细胞分析和亚群分析。Athena 包含一个群体工具,与细胞计数实验类似,可用于定义每个孔中的细胞亚群,并根据细胞表型量化该亚群的特性。
图像采集和图像分析可以同时、独立地在不同的位置进行。
可以从任何安装了 Athena 软件的计算机上查看和分析数据,从而释放 Hermes 成像仪以供其他人使用。实验时间显著减少,因为 Hermes 系统获取的图像被实时上传到共享存储中,Athena 软件从该共享存储中提取数据进行分析,与图像获取过程并行。实验元数据(例如过滤器、物镜、板类型、场和覆盖范围、时间点、z 堆栈或曝光)存储在数据库中以供将来参考。
直观、简单的视觉结果显示。
Athena 软件提供各种可视化工具来显示分析结果。在每个分析过程结束时,用户可以快速轻松地创建一份总结报告,总结分析参数并呈现结果。如有必要,原始数据可以作为 Excel 文件轻松导出到外部源。
Athena 包含以下所有细胞生物学检测作为现成的应用程序:
应用名称 | 描述 | 颜色通道 | 生物测定 | 量化指标 |
---|---|---|---|---|
细胞计数 | 计数荧光标记的细胞或物体 | 1 色核 | 自噬;细胞凋亡;细胞毒性;细胞活力;细胞增殖;生长率;病毒斑块测定 | 面积;荧光强度 |
细胞形态 | 荧光标记细胞或物体形状量化非常适合评估细胞健康 | 1 色细胞质 | 亚细胞特征量化:细胞核;肌动蛋白;微管;高尔基体;囊泡;粘着斑;线粒体 | 面积周长。形状指标:长轴/短轴长度;伸长率;凸包 (CH) 面积;坚固性 |
蛋白质表达 | 单细胞荧光强度定量 | 3 种颜色 细胞核 细胞质 感兴趣的蛋白质 | 细胞健康评估;蛋白质降解;蛋白质定位;蛋白质易位;细胞内分布分析;自噬(t1/2)测定;泛素化;蛋白质聚集和积累;转染效率;基因治疗;药理学和药代动力学 | 面积;周长荧光强度 |
细胞周期 | 使用定量 DNA 标记确定细胞周期群体 | 1 色核 | 增殖测定;细胞周期停滞检测;细胞毒性;细胞活力 | 面积;荧光强度 |
易位 | 量化亚细胞区室之间的强度比 | 3 种颜色 细胞核 细胞质 感兴趣的蛋白质 | 核信号传导分析;先天免疫反应;细胞器内定位;细胞内分布分析 | 荧光强度;细胞核/细胞质强度比 |
专业应用:
应用名称 | 描述 | 颜色通道 | 生物测定 | 量化指标 |
---|---|---|---|---|
细胞内颗粒 | 量化细胞质颗粒的形状、强度和数量 | 3 种颜色细胞核细胞质颗粒通道” | 蛋白质聚集;囊泡运输;点状分析;胞吞/胞吐;受体或蛋白质聚集 | 颗粒数;颗粒强度;颗粒面积和形状 |
菌落中的细胞计数 | 根据单细胞荧光强度推断菌落计数 | 1 颜色 细胞核或细胞 | 细菌菌落细胞计数;小而高密度的细胞菌落,例如胚胎干细胞 | 群体:单细胞、菌落;形态;荧光强度 |
核内灶 | 检测并量化核内病灶和斑点 | 3 种颜色 细胞核 细胞质 焦点通道 | 核内蛋白质聚集;核仁检测;转录因子检测;染色质检测 | 核面积;焦点数;焦点强度;焦点面积和形状 |
定量细胞计数 | 对细胞或细胞核内的生物标志物或物体进行多重定量 | 1-7 种颜色 细胞核或细胞 每个感兴趣的对象 1 种颜色 | 细胞毒性;自噬;细胞凋亡;细胞融合;多质粒转染;活/死测量;细菌活力;多色病灶/斑点 | 每个物体的计数;每个物体的强度 |
活死毒理学 | 使用细胞活力标记物量化活细胞与死细胞 | 2 种颜色 活细胞 死细胞 | 细胞毒性;毒理学;细胞活力;药理学和药代动力学 | 活细胞计数;死细胞计数 |
球体形态 | 3D 细胞培养的形态和荧光强度量化 | 1 色核或明场 | 药物剂量反应曲线;细胞毒性;毒理学;生长曲线;药理学和药代动力学 | 面积;周长;形态;坚固性;荧光强度 |
菌落检测 | 无标记细胞集落检测提供每个集落的真实单细胞计数 | 布赖特菲尔德 | 克隆形成试验;放射治疗试验;剂量反应曲线;细胞活力和增殖;药理学和药代动力学 | 菌落指标:单细胞计数;大小;形态 |
酵母定量 | 明场酵母细胞分割和计数 | 明场+荧光 | 细胞复制和增殖;基因分析;RNA 与酵母细胞内细胞器的共定位 | 计数近距离事件;每个细胞的 RNA 点数;每个细胞的细胞器数 |
光纤检测 | 检测纤维和细胞骨架的细胞内结构 | 1 色光纤 | 细胞骨架重排 | 纤维长度 每个细胞的数量;荧光强度 |
汇合 | 无标记测量细胞或菌落覆盖的面积分数 | 布赖特菲尔德 | 细胞活力和增殖;放射治疗试验;生长率;群体药理学和药代动力学 | 汇合度;细胞总面积 |
线粒体量化 | 线粒体分布、形态和强度的量化 | 3 种颜色 细胞核 细胞质 线粒体 | 细胞代谢;细胞健康和活力;线粒体动力学:数量;大小;分布 | 每个细胞的线粒体数量;线粒体的强度;形态特性;与细胞核的距离 |
共定位 | 测量荧光物体之间的距离 | 2 种颜色 | 蛋白质-蛋白质相互作用;细胞内运输;胞内/胞吐;亚细胞药物封存 | 共定位像素数;共定位面积 |
共定位 | 测量荧光物体之间的距离 | 2 种颜色 | 蛋白质-蛋白质相互作用;细胞内运输;胞内/胞吐;亚细胞药物封存 | 共定位像素数;共定位面积 |
明场细胞计数 | 贴壁细胞培养中的无标记细胞计数 | 布赖特菲尔德 | 细胞活力和增殖;放射治疗试验;生长率;药理学和药代动力学 | 计数细胞面积 |
斑马鱼 | 检测斑马鱼内的荧光结构或物体 | 双色明场荧光物体 | 细菌感染;转移生长试验 | |
秀丽隐杆线虫 | 检测秀丽隐杆线虫内的荧光结构或物体 | 双色明场荧光物体 | 细胞类型识别 | |
划痕试验 | 检测划痕边缘,测量划痕面积相对于总面积 | “2 色明场荧光物体 | “伤口愈合划痕试验 |
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